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제1화 : 우주해적, 나타나다(宇宙海賊現る)
우주제국 잔갸크(宇宙帝国 ザンギャック)의 대함대가 지구를 침략하기 위해 총공격을 해온다. 서른넷팀의 슈퍼전대 전사들은 지구를 지키기 위해 그들과 맞서 싸워 격퇴하지만 모든 힘을 잃어버리게 된다.
그로부터 5년 뒤 지구의 숨겨진 우주 최대의 보물을 찾기 위해 해적전대 고카이져(海賊戦隊ゴーカイジャー)가 나타나는데 지구 재침공을 노리는 우주제국 잔갸크의 선견대를 만나 전투를 벌이게 된다. 고카이오(ゴーカイオー)의 압도적인 파워로 잔갸크 일당을 물리친 해적전대는 지구에 도착하여 지구인들에게 우주 최대의 보물을 내놓으라 하지만 지구인들은 어리둥절할 뿐이다.
허탈해진 해적전대는 허기짐을 달래기 위해 카레전문점으로 향하지만 잔갸크의 침략으로 카레전문점이 파괴되면서 음식을 먹지 못하게 된다. 분노한 해적전대는 어린아이들에게 해코지하려는 행동대장 시카바넨(行動隊長 シカバネン)과 잔갸크 일당을 만나게 되고 레인저 키를 이용한 변신술을 사용, 그들을 격퇴한다.
지구인들은 그들에게 감사의 말을 전하지만 해적전대의 리더 캡틴 마벨러스(キャプテン マーベラス)는 카레를 못 먹게 되어 싸웠다고 대답하며 발길을 돌린다.
제2화 : 이 별의 가치(この星の価値)
지구를 노리는 잔갸크 일당을 피해 숨겨져 있다는 지구의 보물을 찾으려고 고심하는 해적전대. 내비(ナビィ)의 신기(?)에 따라 검은 옷을 입은 사람을 찾아나선다. 그 때 검은 교복을 입은 소년이 나타나 해적전대에게 보물이 있는 곳을 알고 있다며 안내한다.
하지만 캡틴 마벨러스는 소년이 레인저 키를 훔칠려고 유인한 것을 눈치챘고 들켜버린 소년은 도망친다 . 하지만 소년은 이미 레인저 키를 훔치는데 성공했던 것. 레인저 키를 도난당한 것을 깨닫은 캡틴 마벨러스는 소년을 뒤쫓는다. 한편 해적전대에게 당한 잔갸크 일당은 새로운 행동대장 본건(行動隊長 ボンガン)에게 지구 정복을 명령한다.
레인저 키를 훔쳐간 소년을 찾은 캡틴 마벨러스. 소년은 레전드 대전 때 자신을 지키다 돌아가신 할아버지의 복수와 지구를 지키기 위해 레인저 키로 변신하려 했다고 훔친 이유를 설명했고 캡틴 마벨러스는 과거 아카레드(アカレッド)가 자신을 지켜주었던 일을 회상한다. 회상도 잠시, 행동대장 본건을 중심으로 잔갸크 일당이 지구를 습격한다.
소년에게 복수의 기회를 주는 캡틴 마벨러스. 소년은 신켄레드(シンケンレッド)로 변신하여 잔갸크 일당과 대적하나 패배한다. 역부족임을 깨달은 소년은 레인저 키를 캡틴 마벨러스에게 넘겨주고 캡틴 마벨러스는 츤데레 감성을 불태우며 잔갸크 일당과 싸워 물리친다. 하지만 잔캬크의 개발기관 인산(開発技官 インサーン)이 새로 발명한 특수 에너지총으로 패배한 본건등을 거대화시킨다. 해적전대도 고카이갈레온(ゴーカイガレオン)과 머신들에 탑승하여 대응한다. 결국 해적전대의 호쾌한 승리로 끝나는데 그들을 멀리서 검은 로브를 입은 사람이 지켜보고 있다.
제3화 : 용기를 마법으로 바꾸어 ~마지・마지・고・고카이~(勇気を魔法に変えて 〜マージ・マジ・ゴー・ゴーカイ〜)
조종기판의 고장으로 표류하는 마벨러스 일행. 갑자기 나타난 쟌갸크전함이 마벨러스 일행이 탑승한 고카이갈레온과 충돌한다. 그로 인해 고카이 갈레온은 지상에 불시착을 하게 되고 마벨러스 일행은 행동대장 샐러맨덤(行動隊長 サラマンダム)이 이끄는 잔갸크 일당과 결투를 벌이게 된다.
이 소식을 접한 우주제국 잔갸크의 사령관 왈즈 길(司令官 ルズ ギル)은 샐러맨덤에게 임무를 변경하여 해적전대를 먼저 소탕하라고 명령한다. 전투 도중 튕겨져 나간 마벨러스와 돈 도고이어(ドン ドッゴイヤー)는 숲 속에서 검은 로브를 입은 사람을 만나게 되고 내비의 예언을 기억한 도고이어는 검은 로브를 입은 사람에게 보물을 알고 있냐고 묻는다. 검은 로브를 입은 사람은 자신을 잡는다면 보물에 대해 알려 주겠다하며 어디론가 튀어버리고 마벨러스와 도고이어는 그를 쫒는다. (다른 일행은 잔갸크 일당과 싸우느라 정신없다)
천신만고 끝에 검은 로브를 입은 사내를 거의 잡게 된 마벨러스와 도고이어. 하지만 갑툭튀한 샐러맨덤으로 인해 마벨러스는 위기에 처하고 겁이 많던 도고이어가 용기를 내어 마벨러스를 구해낸다. 도고이어의 용기에 감탄한 검은 로브를 입은 사람은 도고이어에게 서른넷의 수퍼전대의 힘을 전부 쓸 수 있다면 보물을 얻을 수 있게될 것이라며 말하고 사라진다. 검은 로브의 사람은 마지 레드(マジ レッド)인 오츠 카이(おづ かい).
해적전대는 다시 모이게 되고 그 앞에 샐러맨덤이 다시 등장한다. 샐러맨덤의 화염폭파공격에 고전하는 마벨러스 일행. 하지만 새롭게 얻게 된 마법의 힘으로 샐러맨덤을 격파한다. 쟌갸크 제국의 개발기관 인산은 지난 번처럼 특수 에너지총을 사용, 샐러맨덤등을 거대화시켜 최후의 반격에 나서지만 마법의 힘으로 더욱 강력해진 변신 합체 로봇 마지고카이오(マジゴーカイオー) 앞에선 무력했다. 그 광경을 본 오츠 카이는 아빠 미소를 지었고 내비는 자신의 예언이 맞았다며 우쭐해한다.
제4화 : 무엇을 위한 동료인가(何のための仲間)
마지고카이오에 이어 새로운 합체 바리에이션을 시도해보는 고카이저 일행. 하지만 새로운 합체 형태는 발견되지 않는다. 실망한 일행들에게 캡틴 마벨러스는 식사당번의 차례를 알려준다. 한 편, 지구 밖 잔갸크 일당의 기함 기간트 호스(旗艦ギガントホース)에 새로운 행동대장 조도마스(行動隊長 ゾドマス)가 도착한다. 화려한 검술을 선보이며 사령관 왈즈 길의 신망을 얻은 조도마스는 지구로 출격한다.
쇼핑을 마치고 돌아가던 조 깁켄(ジョー ギブケン)과 아임 드 파미유(アイム ド ファミーユ)는 검술로 도시를 파괴하는 조도마스 일당과 맞닥트리고 고카이저의 나머지 일행이 도착하면서 전투가 벌어진다. 그 와중에 검술로 라이벌 구도를 펼치는 고카이블루 조 깁켄과 조도마스. 조도마스의 화려한 검술에 조 깁켄은 패배하고 자존심에 스크래치를 입는다.
식사도 거른 체 검술 연마에 정진하는 조 깁켄. 걱정이 된 아임 드 파미유는 일대일로 싸우지 말고 협력하여 싸우자고 제안하지만 조 깁켄은 자신의 일이니 내버려 달라고 말한다. 이로 인해 괴로워하는 아임 드 파미유에게 루카 밀피(ルカ ミルフィ)가 찾아와 조 깁켄의 행동엔 그럴만한 이유가 있을 것이니 믿어주는 것도 필요하다고 이야기 해준다.
아임 드 파미유의 고카이 샤벨(ゴーカイサーベル)을 건네 받고 다시금 조도마스와 일대일로 붙는 조 깁켄. 하지만 조도마스는 부하들을 동원하여 조 깁켄을 무력화시키고 일방적인 공격을 가한다. 이 때 마벨러스 일행이 도착하여 조도마스의 부하들을 상대해주며 조 깁켄과 조도마스의 일대일 대결을 만들어준다. 새로운 조드마스의 기술에 밀리는 고카이블루 조 깁켄. 하지만 동료들이 건네 준 고카이 샤벨을 십분 활용하여 조드마스를 물리친다.
이제는 자리를 잡아가는 잔갸크 개발기관 인산의 특수 에너지총이 조도마스 등을 거대화시키고 고카이저 일행도 고카이오로 대적을 해준다. 거대화 된 조도마스는 별다른 활약을 하지 못하고 마지고카이오의 필살기인 고카이마지바인드(ゴーカイマジバインド) 한 방에 훅 가버린다. 조 깁켄은 동료들에게 고마운 의미로 케이크를 만들어 선물해주며 훈훈하게 끝난다.
마지막 업데이트 2018.03.19